L’université de Bordeaux compte plus de 50 000 étudiants et 4 000 enseignants-chercheurs dans les domaines des sciences humaines et sociales, des sciences de la vie, des sciences de la santé et des sciences et technologies. Il s'agit de la plus grande université de la région Nouvelle-Aquitaine. Elle dispose de plusieurs sites à l'intérieur de la métropole de Bordeaux, notamment au sein du domaine universitaire de Talence Pessac Gradignan, mais aussi dans les villes d'Agen et Périgueux.
L’origine de l’université de Bordeaux remonte au Moyen Âge. Depuis le 1er janvier 2014, il existe deux universités dans l’agglomération : l’université de Bordeaux et l’université Bordeaux-Montaigne.