Le musée des Beaux-Arts de Lyon est un musée municipal situé sur la place des Terreaux à Lyon dans l'abbaye de Saint-Pierre-les-Nonnains, plus connu sous le nom de palais Saint-Pierre.
Voulu dès le XVIIIe siècle par les élites lyonnaises, il est formalisé pendant la Révolution française, fondé officiellement en 1801 et ouvert en 1803. Durant le XIXe siècle, il partage ses locaux avec l'École des beaux-arts de Lyon et ses collections contiennent de nombreuses pièces archéologiques ou historiques. Deux particularités donnent une orientation particulière au musée à cette époque : un salon des fleurs, destiné aux dessinateurs de l'industrie soyeuse locale et des salles vouées à l'accrochage de tableaux de peintres lyonnais. Cette priorité donnée à l'acquisition d'œuvres d'artistes locaux n'empêche pas le musée de s'enrichir d'œuvres prestigieuses, telle La Lapidation de saint Étienne, premier tableau connu de Rembrandt.
Sous la Troisième République, des réformes et rénovation entraînent l'agrandissement du musée et une politique d'acquisition d'œuvres contemporaines plus ambitieuse, rare en province et lui permettant d'avoir une collection à vocation encyclopédique. Sous les auspices d'Édouard Aynard, le musée lyonnais est également un des premiers à oser se tourner vers les avant-gardes de l'époque, avec notamment Nave Nave Mahana de Paul Gauguin.
Durant le XXe siècle, cette politique se poursuit avec plus ou moins de difficultés. Avec René Jullian, le musée commence à organiser des expositions ambitieuses d'art moderne, qu'il poursuivra plus ou moins intensément en fonction des directeurs. Le musée s'agrandit et se spécialise à la fois par la cession d'une partie de ses collections aux musée Gadagne et musée gallo-romain de Fourvière, et en récupérant des locaux par le départ de l'École des beaux-arts et de l'Académie de Lyon. À la fin du XXe siècle, le musée connait une transformation importante avec le départ des collections d'art contemporain au Musée d'Art contemporain et une rénovation très importante des salles. La directrice actuelle est Sylvie Ramond.
Le musée présente au public environ 700 peintures, choisies parmi une collection de 2 000 œuvres, dans 35 salles selon un ordre chronologique qui ne propose pas un découpage des écoles européennes de peinture. Les sections les plus riches sont la peinture vénitienne de la Renaissance, la peinture du XVIIe siècle, la peinture française du XIXe siècle et la peinture de la première moitié du XXe siècle. Le département des sculptures dispose de 1 300 pièces exposées dans trois endroits : au premier étage pour les anciennes, dans la chapelle pour les récentes et quelques-unes dans le jardin.
Le public peut également admirer une grande collection d'objets de l'Antiquité, avec des pièces égyptiennes, du Proche et Moyen-Orient, de la Grèce et de l'Italie. Il dispose aussi d'une riche collection d'objets d'art, essentiellement du Moyen Âge ; mais aussi d'objets islamiques, asiatiques, Art nouveau et Art déco. Le médaillier du musée des Beaux-Arts de Lyon possède une riche collection et tout comme le cabinet d'arts graphiques, avec des dessins et gravures de toutes époques.
