La Mission San Juan Capistrano est une mission catholique qui se situe dans la ville de San Juan Capistrano entre Los Angeles et San Diego, en Californie. La mission San Juan Capistrano a été fondée une première fois par le père Fermín Lasuén le 30 octobre 1775 mais elle dut être abandonnée rapidement à cause des menaces amérindiennes. Elle fut restaurée le 1er novembre 1776 par des moines franciscains à une époque où la Haute-Californie faisait partie de la Nouvelle-Espagne, une région de l’Amérique coloniale espagnole. Elle fait partie d’un réseau de 21 missions fondées entre 1769 et 1823, destinées à évangéliser les Amérindiens, mais aussi à mettre en valeur les terres et à contrôler le territoire.
La Mission San Juan Capistrano a été baptisée en l’honneur de Giovanni da Capistrano, un théologien italien du XVe siècle. Sa chapelle sert de cadre aux offices religieux depuis 1782.